Peptiidiga tervisetoit tuleb asetada ainult jahedasse ja kuiva kohta.

Peptiidreaktiivide ja peptiidravimite puhul tuleb neid hoida kuivatis. Külmkuivatatud peptiide võib enne õhu kätte jätmist asetada toatemperatuurile. See vähendab niiskuse mõju ja kui külmkuivatamine ei ole võimalik, on parim viis säilitada väikeses tööproovi mahus. Cys, Met või TrP sisaldavate peptiidreaktiivide puhul on deoksüdatsioonipuhver nende lahustumiseks hädavajalik, sest peptiidreaktiiv oksüdeerub õhuga kergesti ning polüpeptiidreagendist aeglaselt voolav lämmastik või argoon enne pudeli sulgemist vähendab samuti oksüdatsiooni. Gln-i või Asn-i sisaldavad peptiidreagendid lagunevad samuti kergesti ja kõikidel peptiididel on piiratud eluiga võrreldes nendega, mis neid probleemseid lüosiide ei sisalda.
Peptiididel on lai lahustuvus. Peptiidide lahustumatuse peamine probleem on sekundaarsete struktuuride moodustumine. See esineb kõigis, välja arvatud kõige olulisemates peptiidides, eriti paljude hüdrofoobsete jääkidega peptiidides. Sool soodustab sekundaarse struktuuri moodustumist. Soovitame peptiid esmalt lahustada steriilses destilleeritud vees või deioniseerida. Kui on vaja lahustuvust suurendada, võib kasutada ultrahelitöötlust. Lahustumine on endiselt probleem, väikese koguse lahjendatud äädikhappe (10 protsenti) või ammoniaagi lisamine hõlbustab lahustumist.
Peptiidreaktiivide pikaajaliseks säilitamiseks on kõige parem külmkuivatada ja külmkuivatatud pulbrit võib säilitada -20 kraadi juures või madalamal mitu aastat, ilma et see laguneks või ei laguneks üldse. Peptiidid lahuses ei ole kaugeltki stabiilsed. Peptiidid on vastuvõtlikud bakterite poolt lagunemisele ja need tuleb lahustada steriilses puhastatud vees.
Met-, Cys- või Tyr-jääke sisaldavate peptiidilahuste eluiga on oksüdatsiooni tõttu piiratud. Tuleks lahustada anaeroobses lahustis, korduva külmutamise-sulatamise hävitamise vältimiseks on soovitatav kakakatses lahustada liigne peptiid ja ülejäänud polüpeptiid säilib tahke moodustisena.